Scientific Data Platform Engineer (f/m/x)

Scientific Data Platform Engineer (f/m/x)

Biomedizinische Informatik

• TV-L: 38,5 h/week (100%)
• Befristung: Zunächst auf 2 Jahre befristet mit der Möglichkeit der Verlängerung gemäß WissZeitVG im Rahmen eines drittmittelgeförderten Projekts
• Vergütung: TV-L EG 13

Ihre Aufgaben

• Analyse des Daten-Ökosystems: Bewertung von Datensystemen, Schnittstellen und Datenqualität; Evaluierung von Sicherheit/Datenschutz und Interoperabilität (Daten- bis Benutzerebene).
• Daten- & Schnittstellenarchitektur: Mitarbeit am Blueprint für das klinische Nephrologie-Daten-Ökosystem (Datenflüsse, API-Spezifikationen, Datenmodelle, Interoperabilitätsstandards).
• Entwicklung & Integration: Implementierung neuartiger KI-Lösungen in Datenintegrationspipelines, Design von Test- und Produktionsumgebungen sowie Software-Deployment.
• Pilotbetrieb & Plattform-Zuverlässigkeit: Betrieb, Test, Monitoring und Feinabstimmung von Datenverarbeitungsmodulen/Pipelines, inklusive Retraining/Optimierung von KI-Komponenten, Log-/Performance-Analysen, Einhaltung aller Sicherheits-/Datenschutzanforderungen sowie Backup und Recovery.
• DevOps/Automatisierung: CI/CD für Datenpipelines und Services, Observability (Metriken/Tracing), Incident Handling, Service Request Management und kontinuierliches Docker-Hardening.
• Zusammenarbeit: Kooperation mit klinischen Teams am UKK und externen Partnern.
• Klinische Datenintegration & Interoperabilität: Betrieb robuster Datenflüsse zwischen Krankenhausinformationssystemen, Review und Feinabstimmung von HL7®/FHIR®-basierten Pipelines, Pseudonymisierung und Einwilligungsmanagement.
• Wissenschaft & Transfer: Beitrag zur Dokumentation, wissenschaftlichen Publikationen und Lessons Learned aus dem Pilotprojekt.
• Vernetzung: Aktive Teilnahme innerhalb des nationalen Netzwerks der Medizininformatik-Initiative.

Ihr Profil

• Ausbildung: Masterabschluss (oder äquivalent) in Biomedizinischer Informatik, Data Science, Informatik oder einem verwandten Bereich.
• Technische Fähigkeiten:
  • Praktische Erfahrung in Data Engineering (ETL/ELT, APIs, Microservices), Interoperabilität (HL7®/FHIR®), Datenqualität und Datenmodellierung.
  • Security & Privacy by Design in der klinischen IT (z. B. IAM/rollenbasierte Zugriffe, Logging/Auditing, Pseudonymisierung, Consent-Workflows).
  • Fundierte Python- (und R-) Kenntnisse; Erfahrung mit SQL/NoSQL; Container/Orchestrierung-Know-how ist ein Plus.
  • Praktische Erfahrung in Deployment und Operations.
• Forschungskompetenz: Analytische Denkweise, Vertrautheit mit FAIR-Prinzipien, Motivation zur Publikation und Präsentation von Ergebnissen.
• Kommunikation: Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit mit Klinikern, Datenvisualisierung und Präsentation vor Forschern und IT-Experten aus der Industrie.
• Nice-to-haves: Erfahrung mit MLOps/Model Serving, Observability-Stacks, Cloud/Hybrid-Infrastruktur (z. B. Azure), Frontend-Prototyping/Dashboards.
• Arbeitsweise: Strukturiert, qualitäts- und sicherheitsorientiert; motiviert zur engen Zusammenarbeit mit klinischer Versorgung, Forschung und Industrie.

Unser Angebot

• Echter klinischer Impact: Sie bringen moderne Daten- und KI-Lösungen in reale Arbeitsabläufe – validiert an zwei führenden MII-Zentren (Uniklinik Köln, Hamburg und Münster).
• DIZ-Tooling & Real-World Data Access: Arbeit mit etablierten DIZ-Services (HL7/FHIR, Pipelines, Pseudonymisierung/Consent) in einem realen Versorgungsumfeld.
• Abwechslungsreiche Rolle: Von der Ökosystemanalyse und Architektur bis zum sicheren Pilotbetrieb.
• Team & Entwicklung: Interdisziplinäres Umfeld mit MeDIC-UKK, BI-K, UKK, UKE, UKM und weiteren klinischen Partnern; Möglichkeiten für Publikationen und Konferenzbeiträge.
• Infrastruktur: Exzellente technische Infrastruktur (Medizinisches Datenintegrationszentrum) und klinische Kooperationen zur Arbeit mit realen Gesundheitsdaten.
• Karriere: Förderung der beruflichen Entwicklung, inklusive Teilnahme an nationalen und europäischen akademischen, Forschungs- und Industriekonsortien.
• Arbeitsumfeld: Förderung von Vielfalt, familienfreundlich, modern und mit flexiblen Home-Office-Optionen.

Kontakt

Dr. Ana Grönke Tel: +49 221 478-96995 Universitätsklinikum Köln AöR Geschäftsbereich Personal Kerpener Str. 62 50937 Köln

Bewerbungsfrist: 2. August 2026 Job-ID: eihpdit5